Développement de Logiciels pour la Recherche Scientifique

Nous développons des plateformes de recherche complètes : LIMS pour le suivi des échantillons, ELN pour la documentation, systèmes de gestion des données de recherche, CTMS et EDC pour les essais cliniques, outils de revue de littérature basés sur l'IA avec RAG, pipelines bioinformatiques, systèmes de biobanque, plateformes d'intégration d'instruments et dépôts institutionnels. Chaque système est personnalisé selon vos flux de recherche, exigences de conformité et systèmes institutionnels.

Les projets varient de 75 000 € à 300 000 € selon la complexité. Un LIMS/ELN de base coûte 75 000-125 000 €, les systèmes d'essais cliniques multi-sites 150 000-250 000 €, les plateformes d'entreprise 250 000-500 000 €+. Les facteurs incluent les intégrations, le volume de données, la conformité réglementaire et les fonctionnalités AI/ML. Contrairement aux licences commerciales (5 000-50 000 €/utilisateur/an), vous possédez le système sans frais récurrents. ROI typique en 12-18 mois.

Les projets typiques prennent 12-16 semaines de la collecte des exigences au déploiement. Les projets simples se livrent en 8-10 semaines, les systèmes complexes en 16-24 semaines. Notre approche échelonnée : semaines 1-2 exigences et architecture, 3-8 développement, 9-12 intégrations, 13-14 tests, 15-16 déploiement. Vous voyez les progrès toutes les 2 semaines. Plus rapide que les logiciels commerciaux (4-12 mois) car nous construisons exactement ce dont vous avez besoin.

Nous concevons les plateformes de recherche pour être conformes au RGPD et aux recommandations de la CNIL dès la conception. Cela inclut la pseudonymisation ou anonymisation des données quand c'est possible, le chiffrement des données en transit et au repos, des contrôles d'accès fins, des journaux d'audit complets et une gestion structurée des bases légales et durées de conservation. Nous intégrons la gestion du consentement, les mécanismes d'exercice des droits (accès, rectification, effacement) et la documentation nécessaire pour les AIPD et registres de traitement. Nous travaillons en coordination avec vos DPO, cellules éthique et juristes pour que l'implémentation technique reflète vos politiques de recherche et vos engagements vis-à-vis des participants.

Oui. Nous nous sommes intégrés à 100+ types d'instruments : spectromètres de masse (Agilent, Thermo Fisher, Waters), séquenceurs ADN (Illumina, Oxford Nanopore, PacBio), microscopes, cytomètres en flux, lecteurs de plaques et manipulateurs de liquides. Nous capturons automatiquement les données, analysons les formats propriétaires, appliquons le contrôle qualité et chargeons dans votre base de données. Pas de transcription manuelle ni de transfert USB. L'intégration prend 2-4 semaines par instrument.

Oui. Nos plateformes utilisent l'apprentissage automatique et le RAG pour automatiser les revues de littérature. Le système recherche simultanément dans PubMed, Scopus, Web of Science, Cochrane, IEEE et arXiv, applique le ML pour cribler des milliers d'articles (réduction de 85-90 % du criblage manuel), extrait automatiquement les caractéristiques d'étude avec RAG et génère des tableaux structurés. Le système apprend de vos décisions. Nous avons aidé des équipes à réaliser des revues de 6 mois en 2-3 semaines.

Nous avons l'habitude de travailler sur des projets de recherche européens impliquant plusieurs pays, institutions et régimes de gouvernance des données. Nous concevons des architectures qui respectent le RGPD et les lois nationales tout en permettant le partage contrôlé entre partenaires : séparation claire des rôles, espaces de travail par projet, jeux de données pseudonymisés pour les analyses, et journaux d'audit partagés. Les mécanismes de gouvernance codent les accords de consortium : qui peut accéder à quoi, dans quel but et pendant combien de temps. Pour les projets Horizon Europe, nous vous aidons à aligner la plateforme avec le plan de gestion des données et les exigences de dépôt dans des dépôts ouverts européens.

LIMS (Système de Gestion de l'Information de Laboratoire) gère les échantillons : suivi, stockage, chaîne de possession, flux de traitement et contrôle qualité. ELN (Cahier de Laboratoire Électronique) documente : protocoles, observations, analyse des données, conclusions et signatures électroniques. LIMS = gestion d'inventaire et flux de travail. ELN = documentation et cahier numérique. La plupart des laboratoires ont besoin des deux. Les systèmes intégrés offrent la meilleure expérience avec protocoles liés aux échantillons et pistes d'audit unifiées.

Oui. Nous migrons des LIMS/ELN/bases de données existants, formats obsolètes (bandes 9 pistes, formats propriétaires), registres papier par OCR, feuilles de calcul et dépôts institutionnels. Notre processus : profilage des données, mappage avec règles de transformation, validation (>99,9 % de taux de réussite), réconciliation et documentation d'audit. Liens maintenus vers les originaux pour traçabilité. Nous avons migré 50+ ans de registres, des millions d'échantillons et des pétaoctets de données, en parallèle du développement.

Nos plateformes capturent automatiquement la provenance complète : identifiants uniques par expérience, protocoles sous contrôle de version, dépôts de code intégrés capturant versions logicielles et dépendances, pipelines documentant chaque transformation, cahiers (Jupyter, R Markdown) avec reproduction en un clic, et conteneurisation (Docker, Singularity) garantissant l'exécution identique. La lignée montre comment chaque résultat a été produit. Taux de reproductibilité >95 %, temps de transfert de méthodes réduit de 60 %.